Posted by 青方 on 二月 9th, 2008 in 科学问题
最近工作涉及到Real Time PCR，要看两种老鼠组织里的一种基因表达量的差别，这样就用到了Real Time PCR。
选择GAPDH作为内对照，每次做Real Time PCR都要走内对照和目标基因，之后在一篇文献里学到了一个比较简单的算法。
首先算出目标基因与内对照基因CT的差，所谓delta CT，然后选择一个需要比较的参照基因，例如wildtype老鼠的目标基因最为参照，这样就可以算出knockout老鼠的目标基因与参照的wildtype老鼠目标基因的差，所谓delta delta CT （算作n）。然后计算2的n次方，在微软Excel里，=POWER（2,n），这样算出来的数的含义是，与wildtype老鼠的目标基因比较，Konckout老鼠的基因要高或低多少倍。
2是个理想数据，实际上有个表达效率问题，一般实际表达效率要低于2，例如1.9，简单的算法就直接用2来算。 十万个为什么（264）
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Posted by 青方 on 一月 24th, 2007 in 科学问题
一般人用“耳屎大的学问”来形容人的学问很少，但耳屎里到底有多少学问，知道的人就很少了。
耳屎的学名叫“耵聍”，是外耳道，就是耳朵眼里的分泌物，英文叫耳蜡。其功能主要是防治异物侵犯鼓膜，这些异物包括灰尘，虫子，当然，耳屎特多导致栓塞的时候，也能阻挡别人的唠叨。
耳屎分成“干的”和“湿的”两种，东亚人包括中日韩人的耳屎绝大部分都是干的。而非洲欧洲人，包括北美人的耳屎有97％的人都属于湿的，南亚人则一半一半。而美洲土著人则和东亚人的一样，估计是从东亚跨越白灵海峡移民到美洲的。
最近一期自然遗传学杂志发表了日本人对耳屎的深入研究，发现了决定耳屎干湿的基因，意义深远。研究还发现，耳屎是湿的人更容易出汗，身体也往往有味道，特别是腋下，这也是欧洲人香水业发达的主要原因，这是耳屎基因决定的。东亚人可能是冻的，身体自我保护，出汗少了，连耳屎都吹干了，最后基因也发生了变化。反过来看，是不是看人的耳屎干湿就能间接了解这个人是不是有腋臭，这个就不清楚了。
耳屎虽然不大，功能也不强，但仔细研究起来，里面的学问还是不少的。
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Posted by 青方 on 十二月 31st, 2006 in 健康问题
这两天美国新闻里介绍了一个没有胃的大家庭，11个表亲，都一股脑把胃切了，原因是为了预防可能发生的胃癌。
这些人的姥姥多年前死于胃癌，原因是一种少见的遗传因素造成的。这些表亲们在进行了遗传学测试后，表明他们都携带了他们姥姥的引起胃癌的基因，将来患胃癌的可能性是70％，于是外科大夫们就预防性地把这11个人的胃都给切了。
切了胃的同志们兴奋地说，“我们将来都会死的，但肯定不会死于胃癌”。当然，没有了胃还怎么得胃癌啊！
这个看着不怎么起眼的新闻，其实有着非常重要的意义，就是遗传预测的具体应用。在大规模测试DNA后，结果会告诉被测试者，你有什么什么很糟糕的基因，所以你可能得上什么什么疾病，你会死的很惨的，既然知道了未来要发生什么，就提前做准备，例如这些人不就都把胃切了吗！
但有些问题还是要问的，例如，这样的大规模DNA测试值不值的？对大众总体健康有什么具体的好处？测试结果一定能预测未来可能发生的疾病吗？除了切除，还有没有其他好一些的方法预防可能发生的疾病？没事就切胃，谁给报销呢？
1998年人们发现这个叫做CDH1的基因突变能引发胃癌，新西兰的一个大家族因为有这个突变，很多人得了胃癌。有这个CDH1基因突变的人，70％的可能会患上胃癌。
手术过程中，外科大夫象是对待真的胃癌患者一样，把这个胃都切掉了，还扫荡了胃周围的淋巴结。然后把肠子和食道连在一气就行了，没有了胃的这11个表亲都说“没胃的感觉也挺好的”！
胃还好办，其他病呢？如果有可能患脑瘤，总不能提前把脑子切了吧！还得想其他办法。
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