圣诞节快乐!

祝各位圣诞节快乐!这两张照片摄于费城。
秋色中的单车
夕阳

美国医疗保险改革过关

今天早晨,美国参议院投票通过了总统欧巴马推动的医疗保险改革法案,60对39票,全部民主党人和无党派人士投票赞成,全部共和党人反对,当民主变成党派之争的时候,民主的积极意义就大打折扣了。

尽管如此,这个法案还是通过了,最后还需要和众议院早些时候通过的类似法案合并,总统才能签字变成法律,这要等到明年初。

这是一个妥协的法案,将覆盖3000万现在没有医疗保险的美国人,也将限制保险公司的很多做法,例如不能拒绝已经生病的人,不能给医疗花费封顶等,也将处罚不买保险的人和单位。

这个法案是穷人的胜利,也将成为美国社会的一剂长效止痛药。

岁末科学界丑闻

2009年很快就要过去了,最近美国阿拉巴马大学伯明翰分校爆出严重的丑闻,蛋白质结构学家H.M. Krishna Murthy在长达十年的时间里在多篇文章中造假,经过大学的调查,认为Murthy发现的蛋白晶体结构包括1BEF, 1CMW, 1DF9/2QID, 1G40, 1G44, 1L6L, 2OU1, 1RID, 1Y8E, 2A01, 和2HR0,违背了化学与物理学的基本原理,不能提供令人信服的原始数据,于是大学的委员会决定撤回已经发表的10篇文章,并建议从蛋白结构的数据库中撤出以上所列的蛋白结构,这些文章发表在很多顶级杂志上,包括1999年JBC一篇,2000年JMB一篇,2001年Cell一篇,2006年PNAS一篇Nature一篇。
这是很严重的事件,10年时间10篇文章,10几种蛋白的结构,全部源自虚假的或不能令人信服的数据,且违背化学与蛋白结构的基本原理,不清楚当初这些文章是如何发表的,甚至还包括Nature和Cell这种审稿非常严格的杂志。
Murthy已经从阿拉巴马大学辞职,有人认为这是科学领域里的犯罪。很多杂志的文章还没有被撤回,估计不久这些杂志就开始行动了。

美国大雪

昨天美国东部被大雪掩盖,我们这里下了近70公分的大雪,记得6年前下过一次和这次类似的大雪。周末的所有活动取消,包括中文学校的起诉事件。

在下大雪前,中文学校发来邮件,说两位董事起诉前任校长和几位学校管理人员,进而起诉了中文学校,具体的起诉内容不清楚,董事状告自己管理的学校,事情还是很少见的。这届董事会是通过民主选举上来的,我猜测起诉的原因是学校管理的实权派“太不把董事当干部”,也验证了那句话,有人的地方就有江湖,特别是有中国人的地方。

一会就去铲雪,重体力劳动!
美东大雪-2

解读大熊猫基因测序的结果

panda最近自然杂志在线发表了中国一项关于大熊猫的研究,中国的学者们把奥运吉祥大熊猫晶晶的DNA序列测了出来,结果非常有意思,现在我试着解读一下。

首先说是熊猫,但基因与狗的DNA序列更接近,与狗一样的基因达80%,与人一样的有68%。其次发现大熊猫自身具备全部的肉食动物特有的消化蛋白质的基因,包括蛋白酶,脂肪酶,乳糖酶等,但并没有任何用于消化植物的基因,例如内切葡聚糖酶,外切葡聚糖酶等草食动物特有的酶。这个很难解释为什么大熊猫是素食主义者,文章作者推测可能是肠道的微生物帮助熊猫来消化植物,这个可以说的通,但显然缺乏足够的证据,这方面是这些年肥胖和糖尿病领域研究的热门领域。人体的绝大部分细胞都不是人体细胞,而是肠道里的微生物(比例高到10比1),这些微生物可能与肥胖的产生有一定的关系,例如有些微生物能帮助宿主吸收食物里的能量,强迫宿主发胖,而有些微生物有能帮助宿主不发胖。熊猫体内的微生物能帮助熊猫消化本身不能消化的竹子,把肉食动物转化成吃素的动物,如果能发现是什么样的微生物在发挥如此巨大的作用,那么可以想象将来如果能把这类微生物转移到人体内,就能极大的解决人类面临的粮食问题,人可以吃草,吃树叶,也可以吃竹子。 继续阅读 »

肿瘤与代谢的因果关系—一个实例

最近一期自然杂志发表了关于脑胶质瘤(gliomas)的一项研究,研究揭示了基因突变,代谢改变与癌症发生之间的因果关系,进一步展示代谢研究在癌症领域的重要意义。
以往的研究发现,脑胶质瘤大多存在着细胞浆异柠檬酸脱氢酶1(isocitrate dehydrogenase 1,IDH1)的突变,比例高达80%,但只发生在一个等位基因上,最常见的突变是R132H。这个酶催化的反应是把异柠檬酸转化酮戊二酸(isocitrate to alpha-ketoglutarate),很多年来人们一直不清楚这个突变的含义,不知道这个特殊的突变与脑胶质瘤发生之间的内在联系。
自然杂志的文章发现这个突变使得IDH1获得了一个新的功能,这个突变的酶能把酮戊二酸转化成2-羟基戊二酸(2-hydroxyglutarate,2-HG)。
这一突变导致的酶功能的改变,造成2-羟基戊二酸在脑内的堆积,而这一物质是引发肿瘤的关键因素。有一种遗传病,表现为2-羟基戊二酸脱氢酶的缺乏,结果是肌体不能把2-羟基戊二酸转化回酮戊二酸,而酮戊二酸是三羧酸循环的中间产物,能被细胞氧化并转化成能量,这个2-羟基戊二酸脱氢酶的缺乏也因此造成2-羟基戊二酸在肌体内大量堆积,这就使得患这种特殊遗传病的人更容易发生神经系统的病变,并增加了患脑肿瘤的风险。
这篇文章解释了一个基因突变所引发的代谢改变,而其代谢产物具有很强的致癌性,这个不仅详细阐述了基因,代谢与癌症发生的因果关系,也为癌症的预防与治疗提供了理论依据。
看来代谢研究不仅仅只是局限在代谢病领域,向其他领域的扩展必将是一个未来科研的重要趋势。
学好生化是成为一名好医生的重要基础,这是本人从事十余年科研的深刻体会。

粉手套舞

这是美国波特兰一家医院的工作人员为宣传乳腺癌的防治所作的视频。从中可以看到美国健康工作者的精神面貌与身材。

百姓的位置

最近几天一直关注四川唐福珍自焚事件,看过李承鹏的博客文章,感慨拆迁最后把老百姓拆到了政府的对面。拆迁更是诞生了一只强大的政府力量,不是军队,不是警察,不是武警,是城管。政府的权利太大,没有权利制衡的因素,全靠“批评与自我批评”来自我约束,其结果就是对生命的漠视。依旧是依靠“青天”治国,制度上与几百年几千年前比较没有什么本质上的进步。

最近读了一些中篇小说,很惊讶那些你读过之后分不清楚新旧中国的小说,何以能过了审查关,太太的解释是,审查部门可能根本就不读书,只是上网和看电视剧。想起石家庄的地震式的城市改造与大规模的拆迁,想起三年大变样的口号,不知道这类口号下有多少被拆迁者的痛苦。

很多时候拆迁是政府出面为开发商减低开发成本,却不知道最终政府要付出高昂的社会代价,把百姓推到了自己的对面。不知道每年8% 的经济增长里有多少是靠拆迁得来的,这种经济增长代价是否也太大了。

前一段时间回国的时候,看到高昂的房价使得很多在北京生活的博士们生活在一种“不能提房子问题”的压抑中,生活的目的变成了一生为开发商和银行挣钱,很多社会腐败可能都可以归结到昂贵的房价上,因为要居住,就不得不拿回扣,高房价不仅压抑房奴的人性,也使得社会道德变得和房价一样畸形。

听说如果到清华大学去做海龟,只能得到40万的住房补贴,这些钱可能只能买到不足20平米的面积,剩下的几十平米怎么办呢?这些问题可能在钱学森海归的时候根本就不存在,住房正限制着中国的人才流动,限制着人才引进,拆迁正改变着社会结构,使得一些人快速发财,一些人被剥夺了住自己房子的权利,被剥夺了说“不同意”的权利。

但愿唐福珍自焚事件能改变这些,否则中国会在这个问题上出大问题。

在美国的老中版“黄禹锡”

最近几篇顶级科学杂志的文章被撤稿,一篇发表于自然医学杂志2006年6月,作者是Qing-Sheng Mi,被撤稿的原因是因为第二作者Zhong-Bin Deng伪造了数据,和黄禹锡当年所犯的错误一样,都是重复使用了一样的图表,详细调查见新科学家杂志的报道。

另外著名的”科学“杂志也发生了撤稿事件,文章的第一作者是Zhiwen Zhang,发表于2004年1月,撤稿的原因是实验结果不能重复,且实验原始记录本丢失,有兴趣的请见新科学家杂志的详细报道

一条有鱼腥味的医疗事故新闻

今天网上新闻说,湖北通城中医院在手术的时候分不清左右,在一位病人的好腿上实施了手术。

这其实是一个很普通的医疗事故,俗话说能分的清楚左右的外科大夫就是好大夫。但我还是在这条新闻里闻到了鱼腥味,首先中医院为什么没有用中医方法正骨,而是进行了手术。其次,给这位病人用的是价值5000元的钛合金钢板,我知道这个钛合金钢板是医院和骨科大夫的金矿,回扣率超过50%,就是说安装一块钢板,相关人员可以拿到2500元,一般情况下都是装2快钢板,一次简单的手术相关人员就额外收入5000元。这样的结果就造成,本来可以正骨的要手术安钢板,本来可以复位打石膏等保守治疗就可以解决问题的,要手术安钢板,本来打几根钉子就可以解决问题的,也要手术安钢板。大夫们会为此夸大病情,卫生部可以调查一下,最近几年钢板的使用率是否有大幅度的提高,如果真是这样,不是说病人每次意外都更严重了,而是说病人摔跤的时候把钱包也摔破了。

建议湖北卫生部门不是把院长撤职了事,而是要调查一下这个骨折业界的行业潜规则,看看成本有多少,回扣有多少,利润有多少,有多少情况属于过度治疗。