月度存档: 十二月 2009

人呼吸的空气量是多少?

看了电影Avatar,发现里面的人离开了面罩活不过几分钟,而潘多拉星球上的蓝色人却能活的好好的,于是问自己一个问题,那个星球上的空气是什么样的?

潘多拉上有大量的绿色植物,这么看来应该和地球上的空气是类似的,就是氧气含量占空气的20.9%,人在氧含量低的环境里不会几分钟都活不过去,看来不是氧气的问题,星球上有很多发光的植物,估计潘多拉的空气里含有有某些气体是人所不能耐受的,所以才需要带面罩过滤空气。这是科学幻想,不能太当真。

但一个很基本的问题还是需要搞清楚的,就是人每分钟能呼吸多少空气?有一项研究发现,不管是大人还是孩子,安静地坐着,每分钟大约呼吸7升空气,相对于体表面积,孩子要多于大人,因为孩子在长身体,身体的代谢率要高些。

任何身体的活动都能增加呼吸的空气量,例如跑步的时候,呼吸量比坐着休息多出5到7倍,可以达到50多升每分钟,一般速度走路,呼吸的空气量也能增加1到2倍,所以走路也是很能锻炼身体的。做家务活,呼吸量也能增加一倍,所以别说做家务不累。

根据这个数据,你可以算出来在污染的空气里,人一天可以吸进肺里多少污染物,例如1994年的研究发现(Annual Reviews of Public Health),空气里的污染物,包括二氧化硫,一氧化碳,铅,臭氧,等等,总量每增加10mg每立方米,人的总死亡率就增加1%,有肺部疾病的人增加3.4%,如果人一天的平均呼吸的空气量是每分钟15升,一天就要呼吸21.6立方米的空气,按照10毫克每立方米计算,就是说可以吸入216毫克的污染物,这个可以解释在污染严重的城市里生活,为什么痰是黑的。

孩子因为相对呼吸更多的空气,所以在空气污染严重的地方生活,对孩子的伤害会更大。

晶体结构造假还有更牛的

井冈山大学前两天本人关注了阿拉巴马大学的撤稿事件,今天看到一个更牛的蛋白晶体结构造假事件,国际晶体学报(Acta Crystallographica Section E)一次性撤稿70篇,这些文章全部来自,中国井冈山大学,一个我从来没有听说过的大学。
到该大学的网站上浏览了一下,我看到了鲜艳的党旗,在一则简短的新闻里,大学说:

化学化工学院钟华、工学院刘涛涉嫌学术造假
学校决定对两人予以停职调查
鉴于我校化学化工学院讲师、硕士钟华和工学院讲师、硕士刘涛涉嫌于2006年至2008年间,在《晶体学报》C分卷或E分卷上发表的70篇论文存在数据造假行为,学校2009年12月23日决定,对钟华、刘涛给予停职处理,接受调查。

科学网胡盛志的博客里有详细的介绍。

还有几位大学没有点名的共同作者:

X.-R. Zeng(曾锡瑞): 化学化工学院前任院长、教授、江西省教学名师、江西省自然科学基金委评委、井冈山大学学科带头人
X.-N. Fang(方小牛): 化学化工学院主持工作副院长、教授、江西省教学名师、江西省自然科学基金委评委、井冈山大学学术带头人
Y. Sui(隋岩): 化学化工学院副院长、教授、博士
H. Zhong(钟华):化学化工学院教师、事件引发者
Y.-Q. Liu(刘荫秋):化学化工学院教师、事件引发者
T. Liu(刘涛):工学院教师、事件引发者

从来没有想到学术造假还有这么牛X的,不知道当初这几位从井冈山大学领到了多少论文奖金,这就是重奖之下出的“学术勇夫”。但愿整治中国学术的革命也从井冈山开始。
图片为井冈山大学的男女晶体结构。 继续阅读 »

尝试WordPress 2.9

视频不需要特殊的插件,直接输入衔接就可以。升级非常顺利,没有任何差错发生,看到了回收站的功能。其他没有看到与2.8X有明显的差别。视频是Nat King Cole唱的,”unforgetable”.

http://www.youtube.com/watch?v=q8tRTZIx298

圣诞节快乐!

祝各位圣诞节快乐!这两张照片摄于费城。
秋色中的单车
夕阳

美国医疗保险改革过关

今天早晨,美国参议院投票通过了总统欧巴马推动的医疗保险改革法案,60对39票,全部民主党人和无党派人士投票赞成,全部共和党人反对,当民主变成党派之争的时候,民主的积极意义就大打折扣了。

尽管如此,这个法案还是通过了,最后还需要和众议院早些时候通过的类似法案合并,总统才能签字变成法律,这要等到明年初。

这是一个妥协的法案,将覆盖3000万现在没有医疗保险的美国人,也将限制保险公司的很多做法,例如不能拒绝已经生病的人,不能给医疗花费封顶等,也将处罚不买保险的人和单位。

这个法案是穷人的胜利,也将成为美国社会的一剂长效止痛药。

岁末科学界丑闻

2009年很快就要过去了,最近美国阿拉巴马大学伯明翰分校爆出严重的丑闻,蛋白质结构学家H.M. Krishna Murthy在长达十年的时间里在多篇文章中造假,经过大学的调查,认为Murthy发现的蛋白晶体结构包括1BEF, 1CMW, 1DF9/2QID, 1G40, 1G44, 1L6L, 2OU1, 1RID, 1Y8E, 2A01, 和2HR0,违背了化学与物理学的基本原理,不能提供令人信服的原始数据,于是大学的委员会决定撤回已经发表的10篇文章,并建议从蛋白结构的数据库中撤出以上所列的蛋白结构,这些文章发表在很多顶级杂志上,包括1999年JBC一篇,2000年JMB一篇,2001年Cell一篇,2006年PNAS一篇Nature一篇。
这是很严重的事件,10年时间10篇文章,10几种蛋白的结构,全部源自虚假的或不能令人信服的数据,且违背化学与蛋白结构的基本原理,不清楚当初这些文章是如何发表的,甚至还包括Nature和Cell这种审稿非常严格的杂志。
Murthy已经从阿拉巴马大学辞职,有人认为这是科学领域里的犯罪。很多杂志的文章还没有被撤回,估计不久这些杂志就开始行动了。

美国大雪

昨天美国东部被大雪掩盖,我们这里下了近70公分的大雪,记得6年前下过一次和这次类似的大雪。周末的所有活动取消,包括中文学校的起诉事件。

在下大雪前,中文学校发来邮件,说两位董事起诉前任校长和几位学校管理人员,进而起诉了中文学校,具体的起诉内容不清楚,董事状告自己管理的学校,事情还是很少见的。这届董事会是通过民主选举上来的,我猜测起诉的原因是学校管理的实权派“太不把董事当干部”,也验证了那句话,有人的地方就有江湖,特别是有中国人的地方。

一会就去铲雪,重体力劳动!
美东大雪-2

解读大熊猫基因测序的结果

panda最近自然杂志在线发表了中国一项关于大熊猫的研究,中国的学者们把奥运吉祥大熊猫晶晶的DNA序列测了出来,结果非常有意思,现在我试着解读一下。

首先说是熊猫,但基因与狗的DNA序列更接近,与狗一样的基因达80%,与人一样的有68%。其次发现大熊猫自身具备全部的肉食动物特有的消化蛋白质的基因,包括蛋白酶,脂肪酶,乳糖酶等,但并没有任何用于消化植物的基因,例如内切葡聚糖酶,外切葡聚糖酶等草食动物特有的酶。这个很难解释为什么大熊猫是素食主义者,文章作者推测可能是肠道的微生物帮助熊猫来消化植物,这个可以说的通,但显然缺乏足够的证据,这方面是这些年肥胖和糖尿病领域研究的热门领域。人体的绝大部分细胞都不是人体细胞,而是肠道里的微生物(比例高到10比1),这些微生物可能与肥胖的产生有一定的关系,例如有些微生物能帮助宿主吸收食物里的能量,强迫宿主发胖,而有些微生物有能帮助宿主不发胖。熊猫体内的微生物能帮助熊猫消化本身不能消化的竹子,把肉食动物转化成吃素的动物,如果能发现是什么样的微生物在发挥如此巨大的作用,那么可以想象将来如果能把这类微生物转移到人体内,就能极大的解决人类面临的粮食问题,人可以吃草,吃树叶,也可以吃竹子。 继续阅读 »

肿瘤与代谢的因果关系—一个实例

最近一期自然杂志发表了关于脑胶质瘤(gliomas)的一项研究,研究揭示了基因突变,代谢改变与癌症发生之间的因果关系,进一步展示代谢研究在癌症领域的重要意义。
以往的研究发现,脑胶质瘤大多存在着细胞浆异柠檬酸脱氢酶1(isocitrate dehydrogenase 1,IDH1)的突变,比例高达80%,但只发生在一个等位基因上,最常见的突变是R132H。这个酶催化的反应是把异柠檬酸转化酮戊二酸(isocitrate to alpha-ketoglutarate),很多年来人们一直不清楚这个突变的含义,不知道这个特殊的突变与脑胶质瘤发生之间的内在联系。
自然杂志的文章发现这个突变使得IDH1获得了一个新的功能,这个突变的酶能把酮戊二酸转化成2-羟基戊二酸(2-hydroxyglutarate,2-HG)。
这一突变导致的酶功能的改变,造成2-羟基戊二酸在脑内的堆积,而这一物质是引发肿瘤的关键因素。有一种遗传病,表现为2-羟基戊二酸脱氢酶的缺乏,结果是肌体不能把2-羟基戊二酸转化回酮戊二酸,而酮戊二酸是三羧酸循环的中间产物,能被细胞氧化并转化成能量,这个2-羟基戊二酸脱氢酶的缺乏也因此造成2-羟基戊二酸在肌体内大量堆积,这就使得患这种特殊遗传病的人更容易发生神经系统的病变,并增加了患脑肿瘤的风险。
这篇文章解释了一个基因突变所引发的代谢改变,而其代谢产物具有很强的致癌性,这个不仅详细阐述了基因,代谢与癌症发生的因果关系,也为癌症的预防与治疗提供了理论依据。
看来代谢研究不仅仅只是局限在代谢病领域,向其他领域的扩展必将是一个未来科研的重要趋势。
学好生化是成为一名好医生的重要基础,这是本人从事十余年科研的深刻体会。

粉手套舞

这是美国波特兰一家医院的工作人员为宣传乳腺癌的防治所作的视频。从中可以看到美国健康工作者的精神面貌与身材。

Page 1 of 212