Real Time PCR的一个简单算法

最近工作涉及到Real Time PCR,要看两种老鼠组织里的一种基因表达量的差别,这样就用到了Real Time PCR

选择GAPDH作为内对照,每次做Real Time PCR都要走内对照和目标基因,之后在一篇文献里学到了一个比较简单的算法。

首先算出目标基因与内对照基因CT的差,所谓delta CT,然后选择一个需要比较的参照基因,例如wildtype老鼠的目标基因最为参照,这样就可以算出knockout老鼠的目标基因与参照的wildtype老鼠目标基因的差,所谓delta delta CT (算作n)。然后计算2n次方,在微软Excel里,=POWER2,n),这样算出来的数的含义是,与wildtype老鼠的目标基因比较,Konckout老鼠的基因要高或低多少倍。

2是个理想数据,实际上有个表达效率问题,一般实际表达效率要低于2,例如1.9,简单的算法就直接用2来算。                          十万个为什么(264)





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